Villa Magnolia cuenta con elementos arquitectónicos de principios del siglo XX, período en el cual fue construida junto con la versión definitiva de la pequeña estación de Pisa San Rossore, que solía ser utilizada por la familia real para llegar a la finca de caza de San Rossore, que está a un par de kilómetros y que ahora es una gran reserva natural que se puede visitar en bicicleta o a caballo. En diciembre de 1998, durante las obras de construcción de un edificio debajo de la estación, comenzaron a emerger restos de un puerto de época romana. Este descubrimiento, de gran importancia arqueológica debido a su increíble estado de conservación, dio lugar al Museo de las Antiguas Naves de Pisa, que se puede visitar cerca de la Villa. En las inmediaciones también se encuentran el antiguo hospital de Santa Chiara, que todavía alberga la facultad de medicina, la facultad de ingeniería y la pequeña estación de tren de San Rossore.